Эукариоттық жасушаның пайда болуы екінші маңызды (тіршіліктің өзі пайда болғаннан кейінгі) эволюциялық оқиға болды. Эукариоттар мен прокариоттардың негізгі және іргелі айырмашылығы - неғұрлым жетілдірілген геномдық жүйенің болуы. Жасуша ядросының пайда болуы мен дамуының арқасында біржасушалы организмдердің үнемі өзгеріп отыратын тіршілік ету жағдайларына бейімделу дәрежесі және гендік жүйеге елеулі тұқым қуалайтын өзгерістер енгізбей тез бейімделу қабілеті күрт өсті.
Цитоплазмасы белсенді метаболикалық процестер аймағы болып табылатын, генетикалық ақпаратты сақтау, оқу және қайталау аймағынан сәтті бөлінген эукариоттық жасуша әрі қарай биологиялық эволюцияға қабілетті болып шықты. Бұл дәуірлік және тағдырлы эволюциялық оқиға, ғалымдардың пікірінше, 2,6 миллиард жыл бұрын екі геологиялық кезеңнің түйіскен жерінде болған - архей және протерозой.
Биологиялық құрылымдардың бейімделгіштігі мен тұрақтылығының өсуі толыққанды биологиялық эволюцияның таптырмас шарты болып табылады. Дәл жоғары бейімделу қабілетінің арқасында эукариоттық жасуша күрделі құрылымдық ұйымы бар көп жасушалы организмдерге айнала алды. Шынында да, көп жасушалы биологиялық жүйелерде геномы бірдей жасушалар өзгеретін жағдайларға бейімделе отырып, морфологиялық қасиеттері жағынан да, функционалдық мүмкіндіктері бойынша да мүлдем басқа ұлпалар түзеді. Бұл эукариоттардың ұлы эволюциялық жеңісі, бұл планетада тіршілік формаларының осындай орасан зор алуан түрлілігінің пайда болуына және адамның өзінің эволюциялық аренасына шығуына әкелді.
Эукариот типті жасушалардың құрылымында прокариоттарға тән емес бірнеше тән белгілер бар. Эукариоттық жасушада генетикалық материалдың көп мөлшері (90%) болады, ол хромосомалық құрылымдарда шоғырланған, бұл олардың дифференциациясын және мамандануын қамтамасыз етеді. Кез келген эукариоттық жасуша жеке ядросының болуымен сипатталады. Бұл жасуша түрінің басты ерекшелігі. Прокариоттардан тағы бір маңызды айырмашылығы эукариот жасушасының органеллалары – тұрақты және әртүрлі жасушаішілік құрылымдар.
Эукариот жасушасы прокариот жасушасымен салыстырғанда әртүрлі заттарды қабылдаудың күрделі көп сатылы жүйесі бар. Табиғатта эукариоттық типтегі типтік әмбебап жасуша жоқ. Олардың барлығығажайып әртүрлілікпен сипатталады, бұл эволюциялық бейімделу қажеттілігіне байланысты. Эукариоттардың өте маңызды ерекшелігі олардың өзіне тән компартменттелуі болып табылады - жасушаішілік мембранамен бөлінген жеке жасуша бөлімшелеріндегі барлық биохимиялық процестердің локализациясы. Эукариоттардың бірқатар күрделі құрылымдық компоненттері бар. Мембраналық жүйе сияқты; негізгі жасушаішілік зат болып табылатын цитоплазмалық матрица; жасуша органеллалары эукариоттардың негізгі функционалдық құрамдас бөлігі болып табылады.
