Биологияда жануарлар, саңырауқұлақтар немесе өсімдіктер патшалығына жататын белгілі бір ағзаны сипаттау үшін оның өзіндік номенклатурасы жасалған. Морфологиясы мен сыртқы түрінің ерекшеліктеріне қарай бір түрге жататынын көрсетеді. Жануарлар үшін ұрықтандыру кезінде құнарлы ұрпақ беру мүмкіндігіне байланысты түрге жатқызу критерийлері қолданылады. Дегенмен, бұл үлгілер тек осы организмдерге қатысты, ал микробтарды бұлай жіктеуге болмайды.
Микробиологиядағы штамм түсінігі
Морфологиялық қасиеттері бар, бірақ биохимиялық және иммунологиялық белгілері әртүрлі организмдердің көп санының болуына байланысты атау үшін стандартты номенклатураны қолдану мүмкін емес. Нәтижесінде штамм сияқты ұғым енгізілді. Бұл белгілі бір жерде белгілі бір сағатта оқшауланған және оқшауланған микробтардың таза дақылы.
Бір штаммға жататын әрбір микроб биохимиялық, морфологиялық, иммунологиялық және генетикалық критерийлері бойынша басқа өкілге ұқсас. Бірақ бір бактерия түрлерінің ішінде мұндай ұқсастық байқалмайды. Сондықтан штамм микробтық мәдениеттің икемді атауы болып табылады. Өйткені тезгенетикалық материалдың алмасуы (мутация) түр ішінде жаңа организмдердің пайда болуына әкеледі, бірақ әртүрлі қасиеттері бар дәл осы анықтама патогенділік пен вируленттілік факторларын дәлірек сипаттауға мүмкіндік береді.
Бактериялық штаммдар
Бактериялардың қолданыстағы номенклатурасы организмдердің түрлерін жіктеуге мүмкіндік береді, бірақ олардың жаңа қасиеттерін сипаттамайды. Соңғылары адам, ауылшаруашылық жануарлары мен өсімдіктері, сондай-ақ басқа микробтар үшін патогенді қоса алғанда, жаңа қасиеттерге ие бола отырып, тез мутация нәтижесінде пайда болады. Ішек таяқшасының мысалын қолданатын номенклатураның мысалы келесідей көрінеді: патшалық - бактериялар, түрі - протеобактериялар, гамма-протеобактериялар класы, қатар - Enterobacteriales, Enterobacteria тұқымдасы. Тұқымы - Escherichia және түрі - Escherichia colli. Дегенмен, әртүрлі қасиеттерді көрсететін Escherichia colli түрінің бактерияларының көптеген дақылдары бар. Олар бактериялардың бөлек штамдарына бөлініп, қосымша атауға ие. Мысалы, Escherichia colli O157:H7.
E. coli өзі адам ішегінде болады және ауру тудырмайды, бірақ O157:H7 штаммы вируленттік факторлардың көп санының болуына байланысты тек патогенді болып табылады. Ол соңғы 5 жылда энтеротоксигенді аурулардың эпидемиясын бастан өткерді.
Вирус штаммдары
Штамм ұғымы - бұл бірдей қасиеттері бар организмдердің оқшауланған, содан кейін белгілі бір уақытта белгілі бір аумақта анықталған және сипатталған икемді атауы. Оның ағымымен вирус антигендік әсерге байланысты жаңа қасиеттерге ие болуы мүмкіндрейф. Бұл оның ата-анасынан гөрі патогенді болуы мүмкін жаңа вирус штамын тудырады.
Сіз тұмау вирусының мысалын қолдана отырып, жаңа штаммдардың пайда болуын анық көрсете аласыз. Ол ортомиксовирустар тұқымдасына жатады және антигендерге (гемагглютининдер мен нейраминидаза) HxNy байланысты аталған. X және Y антигендердің болуын көрсететін сандық мәндер. Мысал ретінде жақында тез үдемелі геморрагиялық пневмониялары бар шошқа тұмауының эпидемиясымен танымал H5N1 болып табылады. Теорияға сәйкес, сол антигендік дрейфке байланысты бұл штаммнан жаңа және аса қауіпті штамм дамуы мүмкін.
Саңырауқұлақ штаммдары және протиста штаммдары
Зеңдер барлық микробтардың ең аз өзгермелі, бірақ олардың биохимиясы да күрделі. Бактериялар мен вирустарға қарағанда күрделі құрылымға байланысты, сондай-ақ гендерді жылдам тасымалдау механизмдерінің болмауына байланысты саңырауқұлақтардың жаңа штаммдарының саны аздап артады. Сондай-ақ кез келген жаңадан табылған саңырауқұлақ штаммы зерттеушілерге жай ғана кездеспеген бұрыннан бар организм деген пікір бар.
Ұқсас жағдай протистердің патшалығында да бар. Олардың мутацияға қабілеттілігі төмен, сондықтан жаңа штаммдардың тез пайда болу ықтималдығы өте аз. Дегенмен, бір түрдегі организмдердің жаңа нұсқалары әлі де пайда болады. Сондықтан олар да бұрын болған, бірақ ашылмаған сияқты.
